درپی انتشار اخباری مبنی بر تصرف خانه اندیشمندان علوم انسانی از سوی شهرداری تهران ، برخی چهره های فرهنگی ضمن حضور در این محل بر ادامه فعالیت این موسسه تاکید ومخالفت خود را با اقدام شهرداری ابراز نمودند.در این راستا خانه اندیشمندان علوم انسانی در بیانیه ای با تشریح عملکرد خود در طول دوازده سال فعالیت شان ، مالکیت شهرداری تهران بر نهاد مذکور را رد نموده است. شهرداری تهران اما نظر دیگری دارد و آن اینکه نحوه واگذاری و بهره‌برداری از برخی مجموعه‌های تحت نظر این نهاد که در سنوات گذشته واگذار شده‌اند می بایست مجددا مورد بررسی قرار گیرد و خانه اندیشمندان علوم انسانی از جمله این مجموعه‌هاست. شهرداری تهران اعلام نموده که بدنبال تغییر فضای کاری در این خانه و ایجاد یک ظرفیت و بستر برای فعالیت همه گروه‌ها، جریانات و ظرفیت‌های دانشگاهی، نخبگانی و دانشجویی است.